Procedimentos:

        Um delator  apontava um herege para a comunidade muitas vezes este apontava o tal herege, para vingar-se  ou eliminar rivais no comércio ou nos negócios, e além disso  garantia sua fé e status perante a sociedade. O condenado não tinha o direito de saber o porquê e nem por quem ele tinha sido condenado, e não tinha direito a defesa, o acusado era torturado enquanto devia confessar todas as heresias que cometeu, como o acusado era muitas vezes inocentes este confessava heresias que nunca foram praticadas apenas para cessar as torturas.

           

        Após ter a confirmação das heresias os inquisidores  o mandavam para as autoridades do estado para que tivesse sua punição(desta forma a igreja limpava suas mãos), esta punição poderia ser morte (geralmente na fogueira), ou prisão

Inquisição em praça pública:

            Além disso há outro procedimento descrito por Michael Baigent e Richard Leigh (historiadores) :

            Ao chegar a uma localidade, os Inquisidores proclamavam que todos seriam obrigados a assistir a uma missa especial, e ali ouvir o "édito" da Inquisição lido em público. No fim do sermão, o Inquisidor erguia um crucifixo e exigia-se que os presentes erguessem a mão direita e repetissem um juramento de apoio à Inquisição e seus servos. Após este procedimento lia-se o "édito", que condenava várias heresias, e mandavam que se apresentassem os culpados de "contaminação".

 Se confessassem dentro de um "período de graça" poderiam ser aceitos de volta à igreja sem penitência, porém teriam que denunciar outras pessoas culpadas que não tivessem se apresentado. Não bastava denunciar-se como herege para alcançar os benefícios do "édito", deveria denunciar os cúmplices.. Em Castela, na década de 1480, diz-se que mais 1500 vítimas foram queimadas na estaca em consequência de falso testemunho, muitas delas sem identificar a origem da acusação contra elas.

            Os tribunais da Inquisição não eram permanentes, eram instalados quando surgia um caso de heresia e após isso eram desfeitos, posteriormente tribunais religiosos de combate a heresias seriam utilizados por igrejas protestantes.

Index:

Durante o período da inquisição fora criado uma lista de livros proibidos chamado Index estes livros eram proibidos por conter conteúdo herege.

Uso do fogo:

       A utilização de fogueiras como maneira de aplicar a pena de morte aos condenados que lhes eram entregues pela Inquisição é o método mais famoso de aplicação da pena embora existissem outros. Seu significado era basicamente religioso uma vez que o fogo simbolizava a purificação, configurando a ideia de desobediência a Deus (pecado) e ilustrando a imagem do Inferno.

Em muitos casos também queimavam-se em praça pública os livros avaliados pelos inquisidores como símbolos do pecado. Quando não era encontrado o autor de tais livros era queimada a sua efígie em praça pública.

Inquisidores:

Um dos mais temíveis representantes da Inquisição foi Tomás de Torquemada, um frade dominicano espanhol. Nomeado como inquisidor pelo papa Inocêncio VIII e prestigiado pela rainha Isabel de Castela, este clérigo promoveu uma feroz caçada contra bígamos, agiotas, judeus, homossexuais, bruxas e hereges. A sua ferrenha atuação acabou fazendo com que a sua fama percorresse os quatro cantos da Espanha e chegasse até aos ouvidos do próprio Vaticano.

 Enquanto os açoitamentos e torturas eram deflagrados, Torquemada passava o tempo sussurrando as suas preces. Ao longo de uma vida toda dedicada a esse tipo de atividade, Torquemada acabou sendo visto com desconfiança pelos dirigentes religiosos da época. Segundo estimativas, através de seus métodos de investigação, cerca de 10 mil pessoas teriam sido condenadas à fogueira. Após ignorar os pedidos de moderação da Igreja, acabou sendo afastado de suas funções. Quatro anos depois, em 1494, acabou morrendo na clausura de um convento na regiã o de Ávila.